北京儿童医院精神科主要服务对象为18岁以下的儿童和青少年，包括精神疾病诊室、心理室、心理访谈室、心理测量室、物理室、沙盘室、生物反馈室、压力与情绪管理室、行为观察室、科学研究室等。
北京儿童医院精神科目前已开设如下专业细分门诊：注意缺陷多动门诊、孤独多动抽动门诊、学习困难门诊、心理咨询门诊、青春期心理咨询门诊、精神病专病门诊、精神残疾评估门诊、脑功能及行为发育门诊、脑认知功能评估门诊、心身会诊联络门诊等。
北京儿童医院精神科主任医师陆小彦，主要从事儿内科及感染性疾病的临床和教学工作，历任总住院医师，主治医师，副主任医师，住院病区主任等。1999年在北京大学第六医院专修儿童心理及精神专科，掌握儿童精神疾病的诊断和原则，同年创办儿童医院心理门诊;2001年在中国科学院心理所医学心理咨询与专业学习，并于2003年研究生班毕业、获心理测量及心理从业资格证书;2004年与首都医科大学合作，引进CES(微量生物电径颅磁刺激)技术儿童各种疼痛、紧张、焦虑、等症状并取得良好效果。
多年来，为方便患者就医，北京儿童医院始终坚持24小时接诊。医院积极践行公立医院改革，推进预约挂号工作，优化服务流程，改善患者就医体验，受到国家卫生健康委的肯定和广大群众的认可。医院还承担了上级部门委派的重大儿童传染病防治、抗震救灾支援、突发公共卫生事件救治等医疗任务。