在棕榈油里，酸的形成是由于棕榈果实中脂肪酶或脂肪酸过氧化氢酶两者中任何一种水解所导致。在未破损的果实中，游离脂肪酸是很低的，但一旦细胞破损，果实脂肪酶活化，在初期游离脂肪酸会急剧上升。
游离脂肪酸上升减缓，直到脂肪酶活性钝化才停止。棕榈油中游离脂肪酸的含量水平，实际上取决于这样三个因素：果实的不成熟程度(过于成熟的果实却易损伤)；果穗预处理(杀酵)达到的程度；以及收获和脂肪酶钝化之间迟延的时间。
在贮藏期间，在工厂真空干燥工段后面可装冷冻机，使油在进入储罐之前，温度降到45-50℃。油装进罐后，对罐内充入惰性气体(二氧化碳、氮气)。也可以在油中加入些抗氧化剂，钝化微量金属，以消除油脂贮藏过程中的氧化作用。另外，采用大容器储油时，氧化作用亦能控制，也减少装卸时油的飞溅。
杂质的多少将直接影响废油的再利用。判断杂质也需要通过专业的仪器或经验去判断。例如废重油的油下杆率，废油滴下的油渍散开程度等都是判定废油杂质的依据。