集装箱运输方式在航空运输中的使用是大势所趋。但因飞机舱位形状特殊，使用的集装箱除在大型飞机货舱中可使用标准箱外，一般要使用尺寸、容积、形状各异的非标准箱。使用集装箱运输主要是是为了提高运输效率，以及节约包装，利于周转等。
1、货物的包装应当保证货物在运输过程中不致损坏、散失、渗漏，不致损坏和污染飞机设备或者其它物品。货物的包装要坚固完好、轻便，符合全程运输要求 2、托运人应当在每件货物的外包装上详细注明收货人和托运人的单位、姓名、详细地址和储运要求。 3、托运人应当在每件货物的外包装上粘贴或者拴挂承运人的货物运输标签。 4、托运人使用旧包装时，必须清除原包装上的残留标记和标签。 5、活体动物、鲜活易腐物品、贵重物品、危险物品等特种货物的包装应符合承运人对该种货物的特定要求。
托运人对运输的货物，应当按照国家主管部门规定的包装标准包装；没有统一规定包装标准的，托运人应当根据保证运输的原则，按货物的性质和承载飞机等条件包装。凡不符合上述包装要求的，承运人有权拒绝承运不符合规格的货物。
托运人必须在托运的货物上标明发站、到站和托运人、收货人的单位。姓名和地址，按照国家规定标明包装储运指标标志。5、国家规定必须保险的货物，托运人应在托运时投保货物运输险。托运人托运货物，应按照民航主管机关规定的费率缴付运费和其他费用。除托运人和承运人另有协议外，运费及其他费用一律于承运入开具货物运单时一次付清。