冬虫夏草菌之子座出自寄主幼虫的头部，单生，细长呈棒球棍状，长4－14厘米，不育顶部长3－8厘米，直径1．5－4厘米;上部为子座头部，稍膨大，呈窄椭圆形，长1．5－4厘米，褐色，除先端小部外，密生多数子囊壳，顶部不育部长1．5－5．5毫米;子囊壳近表面生基部大部陷入子座中，先端凸出于子座外，卵形或椭圆形，长250－500微米，直径80－200微米，每一个子囊内有8具有隔膜的子囊孢子。虫体表面深棕色，断面白色;有20－30环节，腹面有足8对，形略如蚕。